Публикации

В разделе представлены публикации, содержащие результаты, которые были получены исследовательскими коллективами с применением вычислительных ресурсов СКЦ.

Публикация Ссылка
2017 год
1 Kuzmenkov A.I., Peigneur S., Chugunov A.O., Tabakmakher V.M., Efremov R.G., Tytgat J., Grishin E.V., Vassilevski A.A. C-Terminal residues in small potassium channel blockers OdK1 and OSK3 from scorpion venom fine-tune the selectivity. (2017). Biochim. Biophys. Acta 1865, 465-472 Посмотреть
2 Bocharov E.V., Bragin P.E., Pavlov K.V., Bocharova O.V., Mineev K.S., Polyansky A.A., Volynsky P.E., Efremov R.G., Arseniev A.S. The Conformation of the Epidermal Growth Factor Receptor Transmembrane Domain Dimer Dynamically Adapts to the Local Membrane Environment. (2017). Biochemistry 56, 1697-1705 Посмотреть
3 Bocharov E.V., Mineev K.S., Pavlov K.V., Akimov S.A., Kuznetsov A.S., Efremov R.G., Arseniev A.S. Helix-helix interactions in membrane domains of bitopic proteins: Specificity and role of lipid environment. (2017). Biochim. Biophys. Acta 1859, 561-576 Посмотреть
4 A. Yu. Snegirev, V.A. Talalov, V.V. Stepanov, O.P. Korobeinichev, I.E. Gerasimov, A.G. Shmakov. Autocatalysis in thermal decomposition of polymers. Polymer Degradation and Stability, v. 37 (2017) p.p. 151-161 Посмотреть
5 V.N. Ivanov, A.V. Ivanova, A.P. Turin and K.Y. Zamotin. Simulation of Heat-Exchange Processes in Coaxial Flues at Abnormally Low Temperatures Journal of Cold Regions Engineering, American Society of Civil Engineers, 2017 Посмотреть
6 P. Spalart, K. Belyaev, A. Garbaruk, M. Shur, M. Strelets, A. Travin. Large-eddy and direct numerical simulations of the Bachalo-Johnson flow with shock-induced separation. FlowTurbulenceand Combustion, 2017 Посмотреть
7 M. Shur, M. Strelets, A. Travin, P.R. Spalart, and T. Suzuki. Unsteady Simulations of a Fan/Outlet-Guide-Vane System. Part 1: Aerodynamics and Turbulence, 23rd AIAA/CEAS Aeroacoustics Conference, AIAA AVIATION Forum Посмотреть
8 Е.К. Гусева, А.В. Гарбарук, М.Х. Стрелец. Разработка и тестирование σ-DDES подхода на основе k-ω SST модели. Труды XXI школы-семинара молодых ученых и специалистов под руководством акад. РАН А.И. Леонтьева (г. Санкт-Петербург, 2017). — М.: Издательский дом МЭИ, 2017, т 1, с. 163-166  
9 A.M. Bykov, E. Amato, A.E. Petrov et al. Pulsar Wind Nebulae with Bow Shocks: Non-thermal Radiation and Cosmic Ray Leptons. Space Science Reviews, July 2017, Volume 207, Issue 1, pp 235-290 Посмотреть
10 V.A. Titarev. Application of model kinetic equations to hypersonic rarefied gas flows // Computers and Fluids, Special issue, 2017 Посмотреть
11 С.И. Смирнов, Е.М. Смирнов, А.А. Смирновский. Влияние теплопереноса в торцевых стенках на турбулентную конвекцию ртути во вращающемся цилиндре // Научно-технические ведомости СПбПУ. Физико-математические науки, Том 10, №1, 2017 Посмотреть
12 E. Kokovina, E. Kuznetsov, A. Snegirev. Numerical simulation of flame spread over vertical combustible surface / Proceedings of the 9th International Seminar on Flame Structure. Novosibirsk, Russia, July 10-14, 2017 Посмотреть
13 A.V. Shvetsov, Y.A. Zabrodskaya, P.A. Nekrasov, V.V. Egorov. Triazavirine supramolecular complexes as modifiers of the peptide oligomeric structure. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. Aug., 2017 Посмотреть
14 Smirnov M.V., Sebelev A.A., Zabelin N.A., Kuklina N.I. Effects of hub endwall geometry and rotor leading edge shape on performance of supersonic axial impulse turbine. Part I // Proceedings of 12th European Conference on Turbomachinery Fluid Dynamics & Thermodynamics. ETC12, Stockholm, Sweden, 2017. ETC2017-100 Посмотреть
15 A.I. Kuzmenkov, S. Peigneur, A.O. Chugunov, V.M. Tabakmakher, R.G. Efremov, J. Tytgat, E.V. Grishin, A.A. Vassilevski. C-Terminal residues in small potassium channel blockers OdK1 and OSK3 from scorpion venom fine-tune the selectivity. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics. Volume 1865, Issue 5, May 2017, Pages 465–472 Посмотреть
16 P. Volynsky, R. Efremov, I. Mikhalev, K. Dobrochaeva, A. Tuzikov, E. Korchagina, P. Obukhova, E. Rapoport, N. Bovina. Why human anti-Galα1–4Galβ1–4Glc natural antibodies do not recognize the trisaccharide on erythrocyte membrane? Molecular dynamics and immunochemical investigation. Molecular Immunology,Volume 90, October 2017, Pages 87-97 Посмотреть
17 V.A. Kuzkin, A.M. Krivtsov. Fast and slow thermal processes in harmonic scalar lattices.  J. Phys.: Condens. Matter, 2017 Посмотреть
18 R.L. Lapin, V.A. Kuzkin. On calculation of effective elastic properties of materials with cracks. Materials Physics and Mechanics, 2017, v.32, No 2, p.p. 213-221 Посмотреть
2016 год
1 A.P. Golovitskii, A.V. Pelli. UV Radiation of Radio Frequency Electronegative Discharge in the Inert Gas − Cl2 Mixture in Association with the Discharge Shape. (2016) 13th International Scientific-Technical Conference on Actual Problems of Electronics Instrument Engineering (APEIE). vol.1, p.p. 16-18 Посмотреть
2 I.S. Polukhin, G.A. Mikhailovskiy, D.A. Rybalko, Yu.V. Solov'ev, E.P. Petukhov and other. Influence of absorber characteristics on operation regimes of passive mode locked lasers based on InGaAlAs/InGaAs/InP heterostructures. Material Physics and Mechanics vol. 29 №1, pp. 71-75, (2016) Посмотреть
3 P. Spalart, K. Belyaev, A. Garbaruk, M. Shur, M. Strelets. Experience of Direct Numerical Simulation of Turbulence on Supercomputers. Communications in Computer and Information Science. 2016. v. 687. Springer-Verlag Посмотреть
4 I.E. Kasheverov, A.O. Chugunov, D.S. Kudryavtsev, I.A. Ivanov , M.N. Zhmak, I.V. Shelukhina, E.N. Spirova, V.M. Tabakmakher, E.A. Zelepuga, R.G. Efremov, V.I. Tsetlin. High-Affinity α-Conotoxin PnIA Analogs Designed on the Basis of the Protein Surface Topography Method. Scientific Reports. 6, Article number 36848 (2016) Посмотреть
5 E.N. Lyukmanova, M.A. Shulepko, Z.O. Shenkarev, I.E. Kasheverov, A.O. Chugunov, D.S. Kulbatskii, M.Yu. Myshkin, Y.N. Utkin, R.G. Efremov, V.I. Tsetlin, A.S. Arseniev, M.P. Kirpichnikov, D.A. Dolgikh. Central loop of non-conventional toxin WTX from Naja kaouthia is important for interaction with nicotinic acetylcholine receptors. Toxicon v.119, September 2016, p.p.274-279 Посмотреть
6 P. Maurice, S. Baud, O.V. Bocharova, E.V. Bocharov, A.S. Kuznetsov, C. Kawecki, O. Bocquet, B. Romier-Crouzet, L. Gorisse, M. Ghirardi, L. Duca, S. Blaise, L. Martiny, M. Dauchez, R.G. Efremov, L. Debelle. New insights into molecular organization of human neuraminidase-1: transmembrane topology and dimerization ability. (2016). Scientific Reports Посмотреть
7 V.A. Titarev. Numerical modeling of high-speed rarefied gas flows over blunt bodies using model kinetic equations. European Journal of Mechanics B/Fluids (2016) Посмотреть
8 A.E. Schmidt, A.V. Shvetsov, A.I. Kuklin, D.V. Lebedev, M.A. Surzhik, V.R. Sergeev, V.V. Isaev-Ivanov. Small-angle scattering study of Aspergillus awamori glycoprotein glucoamylase Crystallography Reports, January 2016, Volume 61, Issue 1, pp 149–152 Посмотреть
9 Kadochnikov V.V., Egorov V. V., Shvetsov A.V., Kuklin A.I., Isaev-Ivanov V.V., Lebedev D.V. (2016). Modeling of conformational transitions of fibrillogenic peptide, homologous to beta-domain of human alpha-lactalbumin. Crystallography Reports, 61(1) Посмотреть
10 Igor Kulikov, Igor Chernykh, and Boris Glinsky. Numerical simulations of astrophysical problems on massively parallel supercomputers. AIP Conference Proceedings 1776, 090006 (2016), Published by the American Institute of Physics Посмотреть
11 К.В. Беляев, А.В. Гарбарук, M.Х. Стрелец, M.Л. Шур, P.R. Spalart. Опыт прямого численного моделирования турбулентности на суперкомпьютерах. Cуперкомпьютерные дни в России: Труды международной конференции (26-27 сентября 2016 г., г. Москва). – М.: Изд-во МГУ, 2016. – 1128 с. с. 357-364 Посмотреть
12 К.В. Беляев, А.В. Гарбарук, M.Х. Стрелец, M.Л. Шур, P.R. Spalart. Опыт прямого численного моделирования турбулентности на суперкомпьютерах. CAD/CAM/CAE Observer, №8 (108), 2016. с.с. 73-78 Посмотреть
13 А.М. Данилишин, Ю.В. Кожухов, Л.В. Гилева, А.А. Лебедев. Верификация CFD-расчета на суперкомпьютере среднерасходных модельных ступеней Суперкомпьютерные дни в России: Труды международной конференции (26-27 сентября 2016 г., г. Москва). – М.: Изд-во МГУ, 2016. – 1128 с. с. 816-828 Посмотреть
14 A.V. Levchenko, E.P. Petukhov. An Extended Model of HPCG Performance for ccNUMA Architectures. Суперкомпьютерные дни в России: Труды международной конференции (26-27 сентября 2016 г., г. Москва). – М.: Изд-во МГУ, 2016. – 1128, с.с. 790-791 Посмотреть
15 А.В. Швецов, Е.П. Петухов. Исследование производительности пакета молекулярной динамики GROMACS на различных архитектурах. Суперкомпьютерные дни в России: Труды международной конференции (26-27 сентября 2016 г., г. Москва). – М.: Изд-во МГУ, 2016. – 1128, с.с. 833-835 Посмотреть
16 И.М. Куликов, И.Г. Черных, Э.И. Воробьев,А.В. Снытников, Д.В. Винс и др. Численное гидродинамическое моделирование астрофизических течений на гибридных суперэвм, оснащенных ускорителями Intel Xeon Phi. Вестник ЮУрГУ. Серия: Вычислительная математика и информатика. 2016. Т. 5,№ 4. С. 77–97 Посмотреть
17 Numerical analysis of the expansion process in a two-stage axial turbine operating with MDM siloxane // A.A. Sebelev, A.S. Saychenko, N.A. Zabelin, M.V. Smirnov / St. Petersburg Polytechnic University Journal of Engineering Sciences and Technology. 2016. №3 (249). pp. 29–38 Посмотреть